В сентябре 2013 года Мортье признался в том, что проходит курс лечения против этой болезни. В то же время ему пришлось покинуть пост руководителя Королевской оперы Мадрида, который он занимал с 2009 года.
До недавнего времени Мортье находился в должности "художественного советника" оперы, а 17 февраля он официально попрощался с Мадридским королевским оперным театром.
В прошлом Мортье также возглавлял оперные театры в Дюссельдорфе, Гамбурге, Франкфурте-на-Майне, Брюсселе и Париже. Кроме того, в течение 10 лет он был директором музыкального фестиваля в Зальцбурге.